ระบบ WCS มีหน้าที่รับผิดชอบในการกำหนดเวลาระหว่างระบบและอุปกรณ์ และส่งคำสั่งที่ออกโดยระบบ WMS ไปยังอุปกรณ์แต่ละชิ้นเพื่อการทำงานที่ประสานกัน มีการสื่อสารอย่างต่อเนื่องระหว่างอุปกรณ์และระบบ WCS เมื่ออุปกรณ์ทำงานเสร็จสิ้น ระบบ WCS จะดำเนินการโพสต์ข้อมูลด้วยระบบ WMS โดยอัตโนมัติ